在噴碼機的日常維護過程中，對操作人員來說很大一部分工作是對噴頭進行人工清洗，如果一臺噴碼機連續工作了若干天，或經過了頻繁的開關機后就需要進行清洗，但許多客戶在使用噴碼機時總有“噴碼機不需人工清洗”的誤區。
就算噴碼機自帶清洗功能，但該設備還是需要人工清洗維護。因為所有噴碼機的自動清洗功能只能清洗內部管道，這時噴頭外部的清潔維護便需要人工操作來完成了。同時，管道與噴頭的維護同樣重要，因為管道堵塞或者噴嘴堵塞都會造成噴碼機無法正常工作，尤其是放假期間，對于大多數房價的企業來說，噴碼機處于關閉狀態，這樣就存在著管路、噴嘴等部位的堵塞風險，所以尤其是在假期前后，要格外注意噴碼機的保養。
根據優良制造規范（CGMP）和世界各地絕大多數相關規定，包括包裝噴碼機在內的所有肉類、家禽或乳制品都必須無銹無腐蝕，以防止產品的潛在污染，一旦在生產設施上發現生銹或腐蝕，將面臨著罰款甚至責令停產的后果。因此，在日常對噴碼機進行維護時，一定要降低噴碼機的生銹風險。
首先需要您對生產環境進行評估，確保噴碼機的作業環境是符合工作要求的，如果使用第三方清潔公司來進行清潔，那么則需要留意其使用的化學制劑是否達標。
其次，購買適合您生產環境的設備和配件設備也決定這噴碼機的耐腐蝕能力。
正確的沖洗流程至關重要，尤其是在使用具有磨蝕性的清潔劑時，不銹鋼可能會被磨損，這就要求人工操作時對噴碼機設備進行沖洗過程中保護。